#மேக்ரோ & மைக்ரோ -டெஸ்ட் வழங்கும் காசநோய் மற்றும் மருந்து எதிர்ப்பு காசநோய்க்கான புரட்சிகரமான கண்டறியும் தீர்வு!

காசநோய் கண்டறிதல் மற்றும் மருந்து எதிர்ப்புத்திறனைக் கண்டறிவதற்கான ஒரு புதிய ஆயுதம்: காசநோய் அதிஉணர்திறன் கண்டறிதலுக்காக இயந்திரக் கற்றலுடன் இணைக்கப்பட்ட ஒரு புதிய தலைமுறை இலக்கு வரிசைமுறைப்படுத்தல் (tNGS).

இலக்கிய அறிக்கை: CCa: tNGS மற்றும் இயந்திரக் கற்றலை அடிப்படையாகக் கொண்ட ஒரு கண்டறியும் மாதிரி, இது குறைந்த அளவிலான பாக்டீரியா காசநோய் மற்றும் காசநோய் மூளைச்சவ்வு அழற்சி உள்ளவர்களுக்குப் பொருத்தமானது.

ஆய்வறிக்கையின் தலைப்பு: காசநோயைக் குறிவைக்கும் அடுத்த தலைமுறை மரபணு வரிசைப்படுத்தல் மற்றும் இயந்திரக் கற்றல்: குறைந்த எண்ணிக்கையிலான நுரையீரல் குழல் புற்றுக்கட்டிகள் மற்றும் குழல் மூளைச்சவ்வு அழற்சிக்கான ஒரு அதிஉணர்திறன் கண்டறியும் உத்தி.

கால இடைவெளி: 《கிளினிகா சிமிகா ஆக்டா》

IF: 6.5

வெளியீட்டுத் தேதி: ஜனவரி 2024

சீன அறிவியல் அகாடமி பல்கலைக்கழகம் மற்றும் கேபிடல் மருத்துவப் பல்கலைக்கழகத்தின் பெய்ஜிங் மார்பக மருத்துவமனை ஆகியவற்றுடன் இணைந்து, மேக்ரோ & மைக்ரோ-டெஸ்ட் நிறுவனம், புதிய தலைமுறை இலக்கு வரிசைப்படுத்தல் (tNGS) தொழில்நுட்பம் மற்றும் இயந்திர கற்றல் முறையை அடிப்படையாகக் கொண்ட ஒரு காசநோய் கண்டறியும் மாதிரியை நிறுவியது. இது, குறைந்த எண்ணிக்கையிலான பாக்டீரியாக்களைக் கொண்ட காசநோய் மற்றும் காசநோய் மூளை அழற்சிக்கு மிக அதிக கண்டறியும் உணர்திறனை வழங்கியதுடன், இவ்விரு வகை காசநோய்களின் மருத்துவ நோயறிதலுக்காக ஒரு புதிய அதிஉணர்திறன் கண்டறியும் முறையையும் வழங்கியது. மேலும், காசநோயின் துல்லியமான நோயறிதல், மருந்து எதிர்ப்புத்திறன் கண்டறிதல் மற்றும் சிகிச்சைக்கும் இது உதவியது. அதே நேரத்தில், காசநோய் மூளை அழற்சியைக் கண்டறியும் மருத்துவ மாதிரி சேகரிப்பிற்கு, நோயாளியின் பிளாஸ்மா cfDNA ஒரு பொருத்தமான மாதிரி வகையாகப் பயன்படுத்தப்படலாம் என்பதும் கண்டறியப்பட்டுள்ளது.

இந்த ஆய்வில், இரண்டு மருத்துவக் குழுக்களை நிறுவுவதற்காக 227 பிளாஸ்மா மாதிரிகள் மற்றும் மூளைத்தண்டுவட திரவ மாதிரிகள் பயன்படுத்தப்பட்டன. இதில், ஆய்வக நோயறிதல் குழுவின் மாதிரிகள் காசநோய் கண்டறிதலுக்கான இயந்திர கற்றல் மாதிரியை நிறுவவும், மருத்துவ நோயறிதல் குழுவின் மாதிரிகள் நிறுவப்பட்ட நோயறிதல் மாதிரியைச் சரிபார்க்கவும் பயன்படுத்தப்பட்டன. அனைத்து மாதிரிகளும் முதலில் மைக்கோபாக்டீரியம் டியூபர்குலோசிஸுக்காக பிரத்யேகமாக வடிவமைக்கப்பட்ட இலக்குப் பிடிப்பு ஆய்வுக் கருவித் தொகுப்பைக் கொண்டு குறிவைக்கப்பட்டன. பின்னர், TB-tNGS வரிசைமுறைத் தரவுகளின் அடிப்படையில், ஆய்வக நோயறிதல் வரிசையின் பயிற்சி மற்றும் சரிபார்ப்புத் தொகுப்புகளில் 5-மடங்கு குறுக்கு-சரிபார்ப்பைச் செய்ய முடிவெடுக்கும் மர மாதிரி பயன்படுத்தப்பட்டது, மேலும் பிளாஸ்மா மாதிரிகள் மற்றும் மூளைத்தண்டுவட திரவ மாதிரிகளின் நோயறிதல் வரம்புகள் பெறப்பட்டன. பெறப்பட்ட வரம்பு, கண்டறிதலுக்காக மருத்துவ நோயறிதல் வரிசையின் இரண்டு சோதனைத் தொகுப்புகளுக்குள் கொண்டுவரப்பட்டது, மேலும் கற்றவரின் நோயறிதல் செயல்திறன் ROC வளைவு மூலம் மதிப்பிடப்பட்டது. இறுதியாக, காசநோயின் நோயறிதல் மாதிரி பெறப்பட்டது.

படம் 1 ஆராய்ச்சி வடிவமைப்பின் திட்ட வரைபடம்

முடிவுகள்: இந்த ஆய்வில் கண்டறியப்பட்ட CSF DNA மாதிரி (AUC = 0.974) மற்றும் பிளாஸ்மா cfDNA மாதிரி (AUC = 0.908) ஆகியவற்றின் குறிப்பிட்ட வரம்புகளின்படி, 227 மாதிரிகளில், CSF மாதிரியின் உணர்திறன் 97.01% ஆகவும், தனித்தன்மை 95.65% ஆகவும், பிளாஸ்மா மாதிரியின் உணர்திறன் மற்றும் தனித்தன்மை முறையே 82.61% மற்றும் 86.36% ஆகவும் இருந்தன. TBM நோயாளிகளிடமிருந்து பெறப்பட்ட பிளாஸ்மா cfDNA மற்றும் மூளைத்தண்டுவட திரவ DNA ஆகியவற்றின் 44 இணை மாதிரிகளின் பகுப்பாய்வில், இந்த ஆய்வின் கண்டறியும் உத்தியானது பிளாஸ்மா cfDNA மற்றும் மூளைத்தண்டுவட திரவ DNA ஆகியவற்றில் 90.91% (40/44) என்ற உயர் நிலைத்தன்மையையும், 95.45% (42/44) என்ற உணர்திறனையும் கொண்டுள்ளது. நுரையீரல் காசநோய் உள்ள குழந்தைகளில், இந்த ஆய்வின் கண்டறியும் உத்தியானது, அதே நோயாளிகளிடமிருந்து பெறப்பட்ட இரைப்பைச் சாறு மாதிரிகளின் எக்ஸ்பெர்ட் கண்டறிதல் முடிவுகளை விட, பிளாஸ்மா மாதிரிகளுக்கு அதிக உணர்திறன் கொண்டது (28.57% எதிராக 15.38%).

படம் 2. மக்கள்தொகை மாதிரிகளுக்கான காசநோய் கண்டறிதல் மாதிரியின் பகுப்பாய்வு செயல்திறன்.

படம் 3. இணை மாதிரிகளின் கண்டறியும் முடிவுகள்

முடிவுரை: இந்த ஆய்வில் காசநோயைக் கண்டறிவதற்கான ஒரு அதிஉணர்திறன் கண்டறியும் முறை நிறுவப்பட்டது. இது, ஒலிகோபேசிலரி காசநோயால் (நுண்ணுயிர் வளர்ப்பில் எதிர்மறை முடிவு) பாதிக்கப்பட்ட மருத்துவ நோயாளிகளுக்கு, மிக உயர்ந்த கண்டறியும் உணர்திறன் கொண்ட ஒரு கண்டறியும் கருவியை வழங்க முடியும். பிளாஸ்மா cfDNA-ஐ அடிப்படையாகக் கொண்ட அதிஉணர்திறன் காசநோயைக் கண்டறிதல், தீவிர காசநோய் மற்றும் காசநோய் மூளைச்சவ்வு அழற்சி ஆகியவற்றைக் கண்டறிவதற்கு ஒரு பொருத்தமான மாதிரி வகையாக இருக்கலாம் (மூளைக் காசநோய் இருப்பதாகச் சந்தேகிக்கப்படும் நோயாளிகளிடமிருந்து மூளைத்தண்டு திரவத்தை விட பிளாஸ்மா மாதிரிகளைச் சேகரிப்பது எளிதானது).

அசல் இணைப்பு: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/s0009898123004990? via%3Dihub

மேக்ரோ மற்றும் மைக்ரோ-டெஸ்ட் காசநோய் கண்டறியும் தொடர் தயாரிப்புகளின் சுருக்கமான அறிமுகம்

காசநோயாளிகளின் சிக்கலான மாதிரிச் சூழல் மற்றும் பல்வேறு தேவைகளைக் கருத்தில் கொண்டு, மேக்ரோ & மைக்ரோ-டெஸ்ட் நிறுவனம், சளி மாதிரிகளிலிருந்து திரவமாக்கிப் பிரித்தெடுத்தல், குவால்காம் லைப்ரரி உருவாக்கம் மற்றும் வரிசைப்படுத்துதல், மற்றும் தரவுப் பகுப்பாய்வு ஆகியவற்றுக்கான முழுமையான NGS தீர்வுகளை வழங்குகிறது. இந்தத் தயாரிப்புகள் காசநோயாளிகளுக்கு விரைவான நோயறிதல், காசநோயின் மருந்து எதிர்ப்புத்திறனைக் கண்டறிதல், மைக்கோபாக்டீரியம் டியூபர்குலோசிஸ் மற்றும் NTM-ஐ வகைப்படுத்துதல், பாக்டீரியா இல்லாத காசநோய் மற்றும் காசநோயாளிகளுக்கு அதிஉணர்திறன் நோயறிதல் போன்றவற்றை உள்ளடக்கியுள்ளன.

காசநோய் மற்றும் மைக்கோபாக்டீரியாவுக்கான தொடர் கண்டறிதல் கருவிகள்:

பொருள் எண்	தயாரிப்பு பெயர்	தயாரிப்பு சோதனை உள்ளடக்கம்	மாதிரி வகை	பொருந்தக்கூடிய மாதிரி
HWTS-3012	மாதிரி வெளியீட்டு முகவர்	சளி மாதிரிகளைத் திரவமாக்கும் சிகிச்சையில் பயன்படுத்தப்படும் இது, சுடோங் இயந்திர உபகரணங்கள் 20230047 என்ற முதல் தரப் பதிவு எண்ணைப் பெற்றுள்ளது.	சளி
HWTS-NGS-P00021	அதிஉணர்திறன் காசநோயைக் கண்டறிவதற்கான குவால்காம் அளவு கண்டறியும் கருவித்தொகுப்பு (ஆய்வுக் கருவி மூலம் காசநோயைப் பிடிக்கும் முறை)	பாக்டீரியா இல்லாத நுரையீரல் காசநோய் மற்றும் மூளைக் கட்டிகளுக்கான ஊடுருவாத (திரவ பயாப்ஸி) அதிஉணர்திறன் கண்டறிதல்; காசநோய் அல்லது காசநோய் அல்லாத மைக்கோபாக்டீரியாவால் பாதிக்கப்பட்டிருக்கலாம் என சந்தேகிக்கப்படும் நபர்களின் மாதிரிகள், உயர்-ஆழ வரிசைப்படுத்தல் மெட்டாஜீனோமிக்ஸ் மூலம் பகுப்பாய்வு செய்யப்பட்டு, காசநோய் அல்லது காசநோய் அல்லாத மைக்கோபாக்டீரியா தொற்று இருந்ததா என்பதற்கான கண்டறிதல் தகவல்களும், மைக்கோபாக்டீரியம் டியூபர்குலோசிஸின் முக்கிய முதல் நிலை மருந்து எதிர்ப்புத் தகவல்களும் வழங்கப்பட்டன.	புற இரத்தம், நுரையீரல் காற்றுப்பை கழுவுதல் திரவம், மார்பு நீர்க்கோவை மற்றும் வயிற்று நீர்க்கோவை, குவியத் துளைப்பு மாதிரி, மூளைத்தண்டுவடத் திரவம்.	இரண்டாம் தலைமுறை
HWTS-NGS-T001	மைக்கோபாக்டீரியம் வகைப்படுத்துதல் மற்றும் மருந்து எதிர்ப்புத்திறன் கண்டறியும் கருவித்தொகுப்பு (மல்டிபிளக்ஸ் பெருக்க வரிசைமுறை முறை)	MTBC மற்றும் 187 NTM உள்ளிட்ட மைக்கோபாக்டீரியம் வகைப்படுத்தல் சோதனை;மைக்கோபாக்டீரியம் டியூபர்குளோசிஸின் மருந்து எதிர்ப்புத்திறனைக் கண்டறிதல், 13 மருந்துகளையும் மருந்து எதிர்ப்பு மரபணுக்களின் 16 முக்கிய பிறழ்வுத் தளங்களையும் உள்ளடக்கியுள்ளது.	சளி, நுரையீரல் காற்றுப்பை கழுவுதல் திரவம், மார்பு நீர்க்கோவை மற்றும் வயிற்று நீர்க்கோவை, குவியத் துளைப்பு மாதிரி, மூளைத்தண்டுவடத் திரவம்.	இரண்டாம்/மூன்றாம் தலைமுறை இரட்டை தளம்

சிறப்பம்சங்கள்: HWTS-NGS-T001 மைக்கோபாக்டீரியம் வகைப்படுத்துதல் மற்றும் மருந்து எதிர்ப்புத்திறன் கண்டறியும் கருவித்தொகுப்பு (மல்டிபிளக்ஸ் பெருக்க முறை)

தயாரிப்பு அறிமுகம்

இந்தத் தயாரிப்பு, உலக சுகாதார அமைப்பின் (WHO) காசநோய் சிகிச்சை வழிகாட்டுதல்களில் விவரிக்கப்பட்டுள்ள முக்கிய முதல் மற்றும் இரண்டாம் நிலை மருந்துகள், NTM சிகிச்சை வழிகாட்டுதல்களில் பொதுவாகப் பயன்படுத்தப்படும் மேக்ரோலைடுகள் மற்றும் அமினோகிளைகோசைடுகள் ஆகியவற்றை அடிப்படையாகக் கொண்டது. மேலும், இதன் மருந்து எதிர்ப்புத் தளங்கள், உலக சுகாதார அமைப்பின் மைக்கோபாக்டீரியம் டியூபர்குளோசிஸ் காம்ப்ளக்ஸ் மரபணு மாற்றப் பட்டியலில் உள்ள மருந்து எதிர்ப்பு தொடர்பான தளங்களின் ஒரு குழுவையும், அத்துடன் உள்நாட்டிலும் வெளிநாட்டிலும் உள்ள உயர் தரமதிப்பீடு பெற்ற ஆய்வுக் கட்டுரைகளின் ஆய்வு மற்றும் புள்ளிவிவரங்களின்படி அறிவிக்கப்பட்ட பிற மருந்து எதிர்ப்பு மரபணுக்கள் மற்றும் மரபணு மாற்றத் தளங்களையும் உள்ளடக்கியுள்ளன.

சீன காசநோய் மற்றும் சுவாச நோய்கள் இதழால் வெளியிடப்பட்ட NTM வழிகாட்டுதல்களில் தொகுக்கப்பட்டுள்ள NTM திரிபுகள் மற்றும் நிபுணர்களின் ஒருமித்த கருத்தின் அடிப்படையில் வகைப்படுத்தல் அடையாளம் காணப்படுகிறது. வடிவமைக்கப்பட்ட வகைப்படுத்தல் பிரைமர்களால் 190-க்கும் மேற்பட்ட NTM இனங்களைப் பெருக்கவும், வரிசைப்படுத்தவும் மற்றும் குறிப்புரைக்கவும் முடியும்.

இலக்கு வைக்கப்பட்ட மல்டிபிளக்ஸ் PCR பெருக்கத் தொழில்நுட்பத்தின் மூலம், மைக்கோபாக்டீரியத்தின் மரபணு வகைப்படுத்தல் மரபணுக்களும் மருந்து-எதிர்ப்பு மரபணுக்களும் மல்டிபிளக்ஸ் PCR மூலம் பெருக்கப்பட்டு, கண்டறியப்பட வேண்டிய இலக்கு மரபணுக்களின் பெருக்கப்பட்ட தொகுப்பு பெறப்பட்டது. பெருக்கப்பட்ட விளைபொருட்களைக் கொண்டு இரண்டாம் அல்லது மூன்றாம் தலைமுறை அதிவேக வரிசைப்படுத்தல் நூலகங்களை உருவாக்க முடியும். மேலும், இலக்கு மரபணுக்களின் வரிசைத் தகவல்களைப் பெறுவதற்காக, அனைத்து இரண்டாம் மற்றும் மூன்றாம் தலைமுறை வரிசைப்படுத்தல் தளங்களையும் அதிவேக வரிசைப்படுத்தலுக்கு உட்படுத்தலாம். உள்ளமைக்கப்பட்ட குறிப்புத் தரவுத்தளத்தில் உள்ள அறியப்பட்ட சடுதிமாற்றங்களுடன் (WHO மைக்கோபாக்டீரியம் காசநோய் கூட்டு சடுதிமாற்றப் பட்டியல் மற்றும் மருந்து எதிர்ப்புடனான அதன் தொடர்பு உட்பட) ஒப்பிடுவதன் மூலம், காசநோய் எதிர்ப்பு மருந்துகளின் மருந்து எதிர்ப்பு அல்லது ஏற்புத்தன்மை தொடர்பான சடுதிமாற்றங்கள் கண்டறியப்பட்டன. மேக்ரோ & மைக்ரோ-டெஸ்ட்டின் தானாகத் திறக்கும் சளி மாதிரி சுத்திகரிப்புக் கரைசலுடன் இணைத்து, மருத்துவ சளி மாதிரிகளின் குறைந்த நியூக்ளிக் அமிலப் பெருக்கத் திறன் (பாரம்பரிய முறைகளை விட பத்து மடங்கு அதிகம்) என்ற சிக்கல் தீர்க்கப்பட்டது. இதன் மூலம், மருந்து எதிர்ப்பு வரிசைப்படுத்தல் கண்டறிதலை மருத்துவ சளி மாதிரிகளுக்கு நேரடியாகப் பயன்படுத்த முடிந்தது.

தயாரிப்பு கண்டறிதல் வரம்பு

34மருந்து எதிர்ப்பு தொடர்பான மரபணுக்கள்18காசநோய் எதிர்ப்பு மருந்துகள் மற்றும்6NTM மருந்துகள் கண்டறியப்பட்டன, அவை உள்ளடக்கியிருந்தன.297மருந்து எதிர்ப்புத் தளங்கள்; பத்து வகையான மைக்கோபாக்டீரியம் டியூபர்குளோசிஸ் மற்றும் பல190NTM-இன் வகைகள் கண்டறியப்பட்டன.

அட்டவணை 1: 18+6 மருந்துகள் +190+NTM பற்றிய தகவல்

தயாரிப்பு நன்மை

சிறந்த மருத்துவப் பொருத்தப்பாடு: சளி மாதிரிகளை வளர்ப்பு முறை இல்லாமல், தானாகவே திரவமாகும் காரணியைக் கொண்டு நேரடியாகக் கண்டறிய முடியும்.

சோதனை செயல்முறை எளிமையானது: பெருக்கும் செயல்பாட்டின் முதல் சுற்று எளிமையானது, மேலும் நூலகக் கட்டுமானம் 3 மணி நேரத்தில் நிறைவடைகிறது, இது பணித்திறனை மேம்படுத்துகிறது.

விரிவான வகைப்படுத்தல் மற்றும் மருந்து எதிர்ப்புத்திறன்: மருத்துவ ரீதியாகக் கவனிக்கப்பட வேண்டிய முக்கிய அம்சங்களான MTB மற்றும் NTM-இன் வகைப்படுத்தல் மற்றும் மருந்து எதிர்ப்புத் தளங்களை உள்ளடக்கி, துல்லியமான வகைப்படுத்தல் மற்றும் மருந்து எதிர்ப்புத்திறனைக் கண்டறிதல், சுயாதீனமான பகுப்பாய்வு மென்பொருளுக்கு ஆதரவளித்தல், மற்றும் ஒரே சொடுக்கில் பகுப்பாய்வு அறிக்கைகளை உருவாக்குதல்.

இணக்கத்தன்மை: தயாரிப்பு இணக்கத்தன்மை, பிரதான ILM மற்றும் MGI/ONT தளங்களுக்கு ஏற்ப தகவமைத்துக் கொள்ளுதல்.

தயாரிப்பு விவரக்குறிப்பு

தயாரிப்பு குறியீடு	தயாரிப்பு பெயர்	கண்டறிதல் தளம்	விவரக்குறிப்புகள்
HWTS-NGS-T001	மைக்கோபாக்டீரியம் வகைப்படுத்துதல் மற்றும் மருந்து எதிர்ப்புத்திறன் கண்டறியும் கருவித்தொகுப்பு (மல்டிபிளக்ஸ் பெருக்க முறை)	ONT, Illumina, MGI, Salus pro	16/96 எதிர்வினை